生態系は様々な生物の相互作用をもち常に変化しながらも、ある程度安定に存在できる複雑なシステムである。どのように変化し、どのように保たれているのか。その原理には、琵琶湖でもアマゾンでも腸内フローラでも、本質的な共通点があるだろう。この共通原理の解明のためには、安定な系から天然では存在すらできない不安定な系まで、様々な系を試験し観察できる実験生態系が強力なツールとなる。しかしこれまで、単離・凍結保存が可能な生物のみから構成され、5種以上の多様性をもって生産者・消費者・分解者（以下、3役）を含み、大量の系を扱える実験系はいままでなかった。本研究では、3役を含み、全て単離・凍結保存が可能な12種の生物を用いて、同時に１万個程度の系を試験できる実験系を構築した。このうち、完全に閉じた系、および、定期的な流入出がある開いた系の両方で、半年以上の間、3役を含む5種以上が存在できる安定な系が存在した。この中には、2種では現れない振動パターンなど、複雑な現象が観察される系もあった。また、キーストーン種をもつ生態系もあり、そのメカニズムも明らかにできた。以上のように、生態系の複雑な現象を再現でき、シミュレーションのように大量の系を調べられる実験プラットフォームが確立された。今後は、生態系の変化や安定性の原理解明、温度など外部環境変化による生態系変化の理解・予測・制御、各生物や生物内の分子から生態系全体を繋ぐ全体の理解など様々な目的において、理論と天然をつなぐプラットフォームとして生態学の進展に貢献するだろう。