微小なゲンゴロウ科昆虫のアマミマルケシゲンゴロウHydrovatus seminarius（以下、本種）は、日本国内では東海・近畿地方及び南西諸島に生息している。しかし、開発による湿地の消失などにより生息環境は減少傾向にあり、環境省レッドリスト2020では準絶滅危惧と評価されている。本種の安定した生息地は本州と南西諸島の数地点に限られており、各地点でも個体群の消失が懸念されている。本州と南西諸島では気候が異なるため、本種の季節消長や生活史形質に差異が生じる可能性がある。地域間で本種の季節消長がどのように異なるのかを把握する事が、保全対策を検討する上で重要と考えられる。また、本種は飛翔能力を持つが、生息地間で遺伝子流動が生じているかは検討されていない。そこで本研究では、本州及び南西諸島における本種の季節消長を把握するとともに、生息地間の遺伝的構造の検証を目的とした。
　国内の生息地のうち、和歌山県と奄美大島のそれぞれ2地点において、2024年10月から2025年9月に毎月1回30分間のたも網を用いた掬い採り調査を行い、成虫・新成虫の個体数を計測した。その結果、両地域で類似した季節変動が認められ、初夏と秋に新成虫が増加し、冬季に水中で確認される個体数が減少したことから、本種は冬季に多くの個体が水中以外で越冬し、年2化している可能性が示された。さらに、季節消長調査を実施した4地点についてMIG-seq法に基づくゲノムワイドSNPsを用いて遺伝的構造解析を行った。その結果、和歌山県と奄美大島では遺伝子流動がほとんど認められず、明確な遺伝的分化が確認された。また、和歌山県内（約2.5 km）と奄美大島内（約12 km）の地点間ではそれぞれ遺伝子流動が生じていたが、奄美大島内ではその程度は低く、地点間の遺伝的分化傾向が認められた。