日本においてタンポポ属は在来種・外来種・雑種が共存し、生育環境のすみ分けが知られるが、そのメカニズムは不明点が多い。近年、植物内生菌が宿主植物の生育環境の拡大や制限に影響を及ぼすことが明らかになっているが、タンポポについての種子内生菌の研究は限られている。本研究では、タンポポ種子内生細菌群集の基礎データを得ること、および群集構成に対する宿主種・採集場所・個体差の影響を把握することを目的とした。
カンサイ、シロバナ、セイヨウ、アカミ、雑種タンポポの5種の痩果を採取し、表面殺菌後の種子から抽出したDNAを用いて16S rRNAv5-v7領域についてアンプリコン解析を行った。
属レベルで65分類群の細菌が検出され、Sphingomonas属やBradyrhizobium属が多くのサンプルから高頻度で検出された。一方で、宿主植物の生育地と種によらず、内生細菌の門の構成は類似していた。またPCoA解析の結果、タンポポの種子内生細菌群集の組成は宿主植物種の生育地と種の両方の影響を受けている可能性がある。

In Japan, native, introduced, and hybrid Taraxacum coexist, yet the mechanisms underlying their habitat differentiation remain unclear. We characterized seed endophytic bacterial communities of five taxa collected from three sites using 16S rRNA amplicon sequencing. We detected 65 bacterial genera, with Sphingomonas and Bradyrhizobium prevalent across many samples, and PCoA suggested that community composition varies with both host taxon and site.